Lotsens hus ligger i en dalsänka på Runmarö i Stockholms skärgård. I dalsänkan finns flera äldre byggnader som avslutas mot havet  med en hamn. Den nya bebyggelsen som adderas till den befintliga bebyggelsen måste följa den äldre byggnadstraditionen. Dalgången ligger läskyddad från havet och har frodig växtlighet med äppellundar och riklig undervegetation.